Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms