Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms