Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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