Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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