Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms