Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms