Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CCDC142Q17RM4 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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