Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms