Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PDE7AQ13946 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms