Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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