Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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