Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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