Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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