Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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