Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms