Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms