Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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PTPRAP18433 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTPRAP18433 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTPRAP18433 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTPRAP18433 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTPRAP18433 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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