Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AP004247.4-201ENST00000608484 942 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SNPHO15079 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SNPHO15079 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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