Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ILF2P2-201ENST00000547482 1117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC015688.5-201ENST00000584605 603 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SMARCE1P7-201ENST00000605515 485 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LYG2-206ENST00000626374 650 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL32-201ENST00000273223 567 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL590617.1-201ENST00000405630 748 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP72-201ENST00000417266 768 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC104170.1-202ENST00000426017 362 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL683807.1-201ENST00000427886 445 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC110994.1-201ENST00000468519 406 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC106795.1-207ENST00000507037 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC004828.1-201ENST00000555303 654 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC02321-201ENST00000555975 384 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC00929-205ENST00000557672 514 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms