Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL24A1Q17RW2 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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