Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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