Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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