Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms