Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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