Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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