Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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