Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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