Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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