Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms