Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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