Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
USF2Q15853 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
USF2Q15853 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
USF2Q15853 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USF2Q15853 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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