Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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