Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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