Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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