Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA13P31271 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms