Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms