Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRBP23467 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRBP23467 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRBP23467 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPRBP23467 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPRBP23467 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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