Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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