Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms