Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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SGCBQ16585 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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SGCBQ16585 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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