Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
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