Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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SKIV2LQ15477 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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SKIV2LQ15477 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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SKIV2LQ15477 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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