Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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