Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms