Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms