Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SREBF2Q12772 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms