Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCAPQ12770 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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