Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
RBBP4Q09028 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms