Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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