Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTL8BQ17RB0 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms